وظائف و اختيارات رئيس كل گمرك بشرح زير است: الف - اداره امور گمركات كشور بر اساس وظائفي كه طبق قوانين و مقررات مربوط و اين آئيننامه باداره كل گمرك محول شده است.
ب
تهيه طرح تشكيلات و شرح وظايف واحدهاي تابع اداره كل گمرك و پيشنهاد آن بوزارت دارائي و اجراي آن پس از تصويب سازمان اموراداري و استخدامي كشور.
پ
انجام كليه امور استخدامي كارمندان و كاركنان طبق قوانين مربوط و نقل و انتقال آنان از واحدي به واحد ديگر تأسيس و تقليل و يا حذفسازمان واحدها بر حسب ضرورت و احتياجات در حدود بودجه مصوب و اعتبارات با رعايت مقررات قانون استخدام كشوري.
ت
امضاء اوراق بهادار - نامهها- قراردادها- اجراي بودجه مصوب اداره كل گمرك و صدور اجازه پرداخت هزينهها و وجوه اختصاصي درحدود قانون تعرفه گمركي و آئيننامه اجرائي قانون مزبور و ساير مقررات مربوط.
ج
نمايندگي اداره كل گمرك در مقابل مراجع اداري و قضائي و مؤسسات خصوصي داخلي و خارجي با حق انتخاب وكيل و اعطاي حق وكالتدر توكيل تا يك درجه.
چ
رئيس كل گمرك ميتواند قسمتي از اختيارات خود را بمسئوليت خود بهر يك از معاونان يا مديران كل و مسئولان ادارات و واحدهايتابعه تفويض نمايد.