هيئت مديره سازمان مركب از سه نفر عضو اصلي و يك عضو عليالبدل است كه به پيشنهاد وزير اصلاحات ارضي و تعاون روستائي وتصويب مجمع عمومي براي مدت سه سال تعيين شده و بهمين ترتيب قابل عزل و نيز تجديد انتخاب ميباشند و در خاتمه مأموريت تا تعيين جانشين مسئوليت ادامه وظايف مربوطه را خواهند داشت. رئيس هيئت مديره از بين سه نفر اعضاي اصلي به پيشنهاد وزير اصلاحات ارضي و تعاون روستائي و تصويب مجمع عمومي انتخاب ميشود عهدهدارسمت مدير عامل سازمان نيز ميباشد.
تبصره 1
وزير اصلاحات ارضي و تعاون روستائي به پيشنهاد رئيس هيئت مديره و مدير عامل سازمان يكي از دو نفر ديگر اعضاي هيئت مديره رابسمت قائم مقام رئيس هيئت مديره و مدير عامل انتخاب مينمايد تا در مواقع غيبت رئيس بجاي وي انجام وظيفه نمايد.
تبصره 2
عضو عليالبدل هيئت مديره در جلساتي كه بعللي يكي از اعضاء اصلي غايب باشند بجاي عضو غايب انجام وظيفه خواهد كرد.