سازمان اوقاف در مورد كليه موقوفات عامه و اماكن مذهبي اسلامي در صورت عدم اقدام متولي حق تقاضاي ثبت و اعتراض و اقامه دعوي دارد و اگر متولي طرف دعوي واقع شده باشد ميتواند بعنوان ثالث وارد دعوي شود و در صورت محكوم شدن متولي بر حكم اعتراض كند. در كليه موارد مذكور سازمان اوقاف از پرداخت مخارج دادرسي و هزينههاي ثبتي و اجرائي معاف ميباشد.