وظائف سازمان بشرح زير است: الف - بررسي بيماريهاي دامي ، شناسائي مناطق و منابع آلوده و راه سرايت و طرز انتشار بيماريها. ب - تأمين بهداشت دام كشور از طريق پيشگيري و مبارزه با بيماريهاي همهگير و قرنطينهاي دام. ج - همكاري با وزارت بهداري در امر مبارزه با بيماريهاي مشترك انسان و دام. د - تأسيس پستهاي قرنطينه در نوار مرزي و داخل كشور بمنظور جلوگيري از سرايت بيماريهاي دامي ،همچنين كنترل بهداشتي و ورود و خروج دام و فرآوردههاي خام دامي و نظارت در نقل و انتقال آنها و صدور گواهي بهداشتي دام و فرآوردههاي خام دامي كه بخارج صادر ميشود. ه - نظارت بهداشتي چراگاهها ، مراتع ، آبشخورها ، محل نگهداري دام و ساير تأسيسات مربوط به پرورش دام همچنين نظارت بر كارخانههايتوليد خوراك دام از لحاظ بهداشتي. و - نظارت بهداشتي كشتارگاهها و كارخانههاي توليد و تهيه فرآوردههاي خام دامي. ز - اظهار نظر و نظارت در مورد ساخت، ورود و صدور و فروش انواع دارو، واكسن، سرم و مواد بيولوژيكي مخصوص دام. ح - مشاركت در كنفرانسهاي بينالمللي دامپزشكي و اعزام نماينده باين كنفرانسها ، در حدود اعتبارات مصوب و پس از تأييد وزير كشاورزي،همچنين مبادله اطلاعات علمي با مراكز و مراجع علمي دامپزشكي. ط - تأسيس و توسعه شبكههاي دامپزشكي همچنين تربيت كادر فني در مناطق و مراكز دامداري كشور. ي - ساير اموريكه در اجراي هدفهاي مندرج در ماده يك از طرف وزارت كشاورزي تعيين و براي اجرا بسازمان ابلاغ ميشود.