هيأت امناي باشگاه بالاترين مرجع تصميم گيري باشگاه و تعداد و تركيب اعضاي آن بدين قرار است:
1
وزير آموزش و پرورش «رئيس هيأت امناء».
2
وزير فرهنگ و آموزش عالي
3
رئيس سازمان ملي پرورش استعدادهاي درخشان
4
هشت نفر از اعضاي هيأتهاي علمي دانشگاهها و معلمان ذي صلاحيت كشور و افراد صاحب نظر كه چهار نفر از آنها پيشنهاد وزير فرهنگ و آموزش عالي و چهار نفر از آنان به پيشنهاد وزير آموزش و پرورش و حكم رئيس جمهور براي مدت چهار سال انتخاب مي شوند.
5
دبير شوراي عالي انقلاب فرهنگي 6-رييس بنياد ملي نخبگان.
تبصره 1
از 8 نفر اعضاي موضوع بند 4 حداقل 2نفر از بانوان، يك نفر به انتخاب وزير آموزش و پروش و يك نفر به انتخاب وزير فرهنگ و آموزش عالي عضويت خواهند داشت.
تبصره 2
عضويت اعضاي بند 4 براي دوره هاي بعدي بلامانع است.