رييس بنياد رييس بنياد (معاون اول رئيس جمهور) بالاترين مقام اجرايي بنياد است. قائم مقام رئيس بنياد از ميان اعضاء هيأت علمي و واجد شرايط زير انتخاب مي شود:
1
داراي توانمندي علمي، پژوهشي و اجرايي در امور مربوط به نخبگان باشد.
2
داراي سوابق علمي و اجرايي درخشان بوده و آشنا با جامعه نخبگان و نيازهاي علمي آنان باشد.
3
آشنا به معيارهاي استاندارد بين المللي و ساز و كارهاي بنيادهاي نخبه پرور جهان باشد.
4
نسبت به نظام هاي علمي، اداري، مالي، اقتصادي و برنامه ريزي و مديريت كشور اشراف داشته باشد.
تبصره
رياست بنياد و قائم مقام ايشان به عنوان سمت آموزشي و پژوهشي محسوب مي شود. ماده 11 الف ـ وظايف رييس بنياد 1 ـ اجراي كليه مصوبات هيأت امناء. 2 ـ اداره و هدايت امور بنياد و نظارت بر حُسن اجراي فعاليت هاي آن در چارچوب اساسنامه، ضوابط و مقررات مصوب هيأت امناء. 3 ـ اداره شوراي نخبگان. 4 ـ تأمين ساز و كار لازم جهت عملياتي كردن ايده هاي نخبگان. 5 ـ هماهنگي و هدايت مراكز علمي، اجرايي، توليدي، خدماتي (دولتي و غيردولتي) براي جذب و بكارگيري نخبگان كشور. 6 ـ پيشنهاد اصلاح و يا تغيير در مواد اساسنامه به هيأت امناء و پس از تأييد هيئت امناء جهت تصويب در شوراي عالي انقلاب فرهنگي. 7 ـ برنامه ريزي براي تقويت روحيه و انگيزه هاي ديني، اخلاقي و ملي نخبگان در جهت خدمت به كشور. 8 ـ ارائه گزارش سالانه از فعاليت هاي بنياد به شوراي عالي انقلاب فرهنگي. 9 ـ اطلاع رساني مناسب و ساليانه به افكار عمومي در مورد فعاليتهاي بنياد. 10 ـ نصب و عزل كاركنان بنياد، تعيين حقوق و دستمزد آنان طبق مقررات و آئين نامه استخدامي بنياد كه به تصويب هيأت امنا مي رسد. 11 ـ حفظ و حراست اموال و دارايي هاي منقول و غيرمنقول بنياد. 12 ـ تهيه گزارش عملكرد سالانه بنياد و ارائه آن به هيأت امناء براي بررسي. 13 ـ نمايندگي بنياد در كليه مراجع اداري و قضايي با حق توكيل به غير براي استيفاي حقوق بنياد در حدود مقررات. 14 ـ ارائه ترازنامه و صورت منابع و مصارف تركيبي سالانه هيأت امناء براي تصويب.