رشته هاي تحصيلي در مدرسه به شرح ذيل است:
الف
فقه و مباني حقوق اسلامي.
ب
كلام و حكمت اسلامي. تاسيس رشته هاي تحصيلي ديگر پس از تصويب برنامه هاي آنها در شورايعالي برنامه ريزي و گرفتن مجوز از شوراي گسترش وزارت فرهنگ و آموزش عالي امكان خواهد داشت.
ماده 8
از اساسنامه مدرسه عالي شهيد مطهري — مصوب 1366/07/21