هيأت تصفيه وظايف زير را دارااست:
1
تعيين تكليف طلابي كه در مدارس تحت پوشش مركز به تحصيل مشغول هستند.
2
دريافت مطالبات و پرداخت ديون و قراردادن اموال مركز در اختيار دفتر مقام معظم رهبري تا به هر نحوي كه صلاح دانستند اقدام نمايند. رئيس جمهور و رئيس شوراي عالي انقلاب فرهنگي ـ سيدمحمد خاتمي