وظايف و اختيارات رئيس هيأت امناء بشرح زير است:
1
ابلاغ خط مشيها، تدابير و مصوبات فرماندهي كل نيروهاي مسلح و همچنين اعلام نيازمنديها و اولويتهاي تحقيقاتي وزارت دفاع وپشتيباني نيروهاي مسلح جمهوري اسلامي ايران به رئيس مؤسسه.
2
تصويب تشكيلات مؤسسه و تغييرات بعدي آن.
3
عزل و نصب رئيس مؤسسه.