هيأت امناء مؤسسه متشكل از وزراء دفاع و پشتيباني نيروهاي مسلح جمهوري اسلامي ايران، فرهنگ و آموزش عالي و دو نفر به انتخاب رئيس جمهور (ترجيحاً از بين وزراي صنعتي، مشاورين رياست جمهوري يا اعضاي شوراي عالي امنيت ملي كشور) و يك نفر نماينده رئيس ستاد فرماندهي كل نيروهاي مسلح و رئيس ستاد مشترك ارتش جمهوري اسلامي ايران و رئيس ستاد كل سپاه پاسداران انقلاب اسلامي مي باشد. رياستهيأت امناء با وزير دفاع و پشتيباني نيروهاي مسلح جمهوري اسلامي ايران است و رئيس مؤسسه به عنوان دبير هيأت امناء و بدون حق رأي در جلسات شركت مي كند.
تبصره
يك نفر از اعضاي كميسيون امور دفاعي مجلس شوراي اسلامي به انتخاب كميسيون مزبور ميتواند بعنوان ناظر در جلسات هيأت امناء شركت نمايد.