بودجه سازمان امور مالياتي كشور و واحدهاي استاني ذيربط هر سال به صورت متمركز در رديف جداگانه اي در قوانين بودجه منظور و به طور صد درصد(100 %) تخصيص يافته تلقي مي شود و جهت انجام هزينه هاي جاري و تملك دارايي هاي سرمايه اي ستاد سازمان و واحدهاي استاني دراختيار سازمان مزبور قرار داده مي شود.