مصوبات شوراي عالي حوزة علمية قم در خصوص اعطاي امتياز علمي به مجلات علمي، تأسيس انجمن هاي علمي، قطب هاي علمي و واحدهاي پژوهشي و همچنين امتيازات كرسي هاي نظريه پردازي، نقد و مناظره و آزاد انديشي در حوزه، داراي اعتبار رسمي بوده و موجد امتيازات قانوني در دانشگاه ها و حوزه هاي علمي مي باشد.
تبصره 1
ايجاد ساز و كارهاي لازم براي اجراي اين مصوبه و تشكيل شورايي به رياست مدير حوزة علميه قم به عنوان مرجع رسمي براي تعيين ضوابط علمي و قانوني و نيز اعطاي مجوزها و امتيازات مذكور براي مجلات، انجمن ها، قطب ها و كرسي هاي ياد شده بر عهدة شوراي عالي حوزه علمية قم است و آئين نامة مربوط به چگونگي فعاليت شوراي مزبور و همچنين تركيب اعضاي حقيقي و حقوقي آن به پيشنهاد مديريت حوزه علميه توسط شوراي عالي حوزه علميه به تصويب مي رسد.
تبصره 2
انجام فعاليت هاي فوق به صورت مشترك ميان حوزه، دانشگاه ها و پژوهشگاه ها مجاز بوده و از سوي دستگاه هاي ذي ربط به رسميت شناخته شده و حمايت مي شود.
تبصره 3
نظارت بر حسن اجراي روند فعاليت هاي فوق و ايجاد هماهنگي و تعامل بين نهادهاي ذي ربط از قبيل وزارت علوم، تحقيقات و فن آوري و ساير دستگاه ها، با شوراي عالي انقلاب فرهنگي مي باشد.» رئيس جمهور و رئيس شوراي عالي انقلاب فرهنگي- محمود احمدي نژاد