هر مؤسسه آموزش عالي غيردولتي غيرانتفاعي پس از كسب مجوز تأسيس داراي يك هيأت امناء با تركيب زير خواهد بود كه براي مدت 4 سال انتخاب مي گردند، انتخاب مجدد اعضا بلامانع است . الف (اصلاحي 20ˏ02ˏ1379) - يك نفر روحاني ب (اصلاحي 20ˏ02ˏ1379) - حداقل سه نفر و حداكثر پنج نفر از اعضاي هيئت علمي دانشگاهها داراي شرايط بند «ب» ماده 2و ماده4.
تبصره (منسوخه 20ˏ02ˏ1379)
بعد از دو سال از شروع كار مؤسسه ، تعداد اعضاي كادر علمي عضو هيأت امنا بايد حداقل به سه نفر برسد. اين افراد بايد دست كم يك سال عضو رسمي مؤسسه بوده باشند. ج - سه نفر از اعضاي هيأت مؤسس . د - نماينده وزارت فرهنگ و آموزش عالي نوع اول (موضوع ماده 10 بند الف) ه ـ - استاندار . تبصره (الحاقي )(الحاقي 13ˏ08ˏ1365) - هرگاه استاندارد در بيش از سه هيأت امناء از موسسات مذكور عضو باشد مشاور يا معاون او مي تواند بجاي او شركت نمايد مشروط بر اينكه به مسائل دانشگاهي آگاه باشد. و - رئيس مؤسسه بدون حق رأي در جلسات هيأت امنا شركت مي كند.
تبصره
هر هيأت امنا داراي يك رئيس به انتخاب اعضا خواهد بود.