اهم وظايف و اختيارات رئيس سازمان به شرح زير ميباشد:
1
اداره امور سازمان.
2
امور استخدامي، عزل ، نصب، ارتقاء و آموزش كاركنان و صدور دستور پرداختها.
3
اجراي مصوبات شوراي سازمان.
4
نمايندگي سازمان در مراجع قضايي و اداري در كليه مراحل، با حق تعيين وكيل يا وكيل با حق توكيل.
5
ارائه گزارش فعاليت و عملكرد به شوراي سازمان.
6
ارائه آئيننامههاي اجرائي و طرحها و پيشنهادهاي لازم براي نيل به اهداف سازمان، به شوراي سازمان جهت تصويب.
7
پيشنهاد امتيازات لازم براي جذب و نگهداري معلمان، مربيان و مديران آموزشگاهها و ساير نيروهاي تحت نظر سازمان، به شوراي سازمان جهت تصويب.
تبصره
رئيس سازمان ميتواند قسمتي از اختيارات خود را به هر يك از رؤساي قسمتهاي سازمان به تشخيص خود، تفويض نمايد.