تركيب اعضاي هيئت امنا: 1 - وزير آموزش و پرورش (رئيس هيئت امنا) 2 -معاون رئيس جمهور و سرپرست سازمان تربيت بدني. 3 -دبير شوراي عالي جوانان. 4 -فرمانده نيروي مقاومت بسيج يا نماينده تامالاختيار او. 5 -رئيس اتحاديه انجمنهاي اسلامي دانشآموزان. 6 -مديرعامل كانون پرورش فكري كودكان و نوجوانان. 7 -چهار نفر از اعضاي اصلي سازمان (دو پسر - دو دختر) به انتخاب مجمع نمايندگان اعضا. 8 -دو نفر از ميان همكاران افتخاري سازمان (يك نفر زن - يك نفر مرد) به انتخاب مجمع عمومي. 9 -دو نفر از افراد مطلع و صاحبنظر در امور پرورشي نوجوانان و جوانان به انتخاب وزير آموزش و پرورش. 10 -دو نفر از معاونان وزارت آموزش و پرورش با انتخاب وزير. 11 -معاون پرورشي وزارت آموزش و پرورش (نايب رئيس هيئت امنا)
تبصره 1
رئيس سازمان دانشآموزي دبير هيئت امنا ميباشد.
تبصره 2
احكام هيئت امنا توسط وزير آموزش و پرورش صادر ميشود.
تبصره 3
دانشآموزان در دور اول به پيشنهاد رئيس سازمان و در دورههاي بعدي با رأي اعضاي كنگره سازمان دانشآموزي انتخاب خواهند شد.
تبصره 4
مصوبات هيئت امنا با رأي 3/2 اعضا و تأييد رياست هيئت امنا قابل اجرا خواهد بود.