اهداف اهداف مركز شامل موارد زير است:
1
تقويت اقداماتي به منظور پيشگيري و مبارزه با فساد به شكلي مؤثرتر و كارآمدتر
2
تشويق سياستهاي مبارزه با فساد و نظارتي (آمبودزماني) كشورهاي عضو
3
همكاري با يكديگر در فراهمايي (كنفرانس) هاي مبارزه با فساد منطقه اي يا بين المللي
4
ترغيب، تسهيل و حمايت از همكاري منطقه اي و بين المللي و ارائه كمك فني در زمينه فعاليتهاي نظارتي (آمبودزماني) و نيز پيشگيري و مبارزه با فساد
5
ارتقاي رتبه كشورهاي عضو در شاخصاي جهاني مبارزه با فساد
6
با توجه به ابزار موجود، تشويق مشاركت فعال بخش دولتي و مشاركت فعال سازمان هاي دولتي و غيردولتي در پيشگيري و مبارزه با فساد و نيز ارتقاي فعاليتهاي نظارتي (آمبودزماني)
7
ايجاد هماهنگي و ارتقاي همكاري ميان سازمان هاي مبارزه با فساد و نهادهاي نظارتي (آمبودزماني) كشورهاي عضو اكو
8
برگزاري فرآهمايي (كنفرانس) هاي منطقه اي تخصصي براي تبادل اطلاعات ، تجارب و دانش در خصوص مبارزه با فساد
9
انجام مطالعه و تحقيق در خصوص چالشهاي ناشي از فساد و ارائه راهكار و نيز تبادل تجربيات مرتبط با مبارزه با فساد از طريق بهبود و تشويق فعاليتهاي نظارتي (آمبودزماني)
10
تدوين استانداردهاي مشترك همكاري در جهت مبارزه با فساد