به منظور اجراي صحيح وظايف و تأمين هماهنگي لازم و ايجاد وحدت عمل در امور جهاد، شوراي مركزي جهاد، مركب از يك روحاني (نماينده مقام رهبري در صورت معرفي معظم له)، وزير و پنج عضو ديگر تشكيل مي گردد.
تبصره 1
پنج عضو شوراي مركزي را، وزير از بين افراد كاردان و متعهدي كه عضو رسمي جهاد و حداقل 3 سال سابقه كار داشته باشند، با‌مشورت مسئولين جهاد مركز و استان ها انتخاب و منصوب مي نمايد. تبصره 2 - قبول استعفا و عزل هر يك از پنج عضو شوراي مركزي، با وزير خواهد بود. ماده 3 (منسوخه 25ˏ12ˏ1382) - وظايف شوراي مركزي جهاد: الف - تصويب مقررات و آيين نامه ها و ضوابط و دستورالعمل هاي داخلي جهاد. ب - اتخاذ تصميمات لازم براي حسن اجراي قوانين و مقررات و آيين‌نامه‌ها در جهاد. ج - تصويب برنامه‌هاي كوتاه مدت و ميان مدت و بلند مدت جهاد. د - تصويب تشكيلات اجمالي و تفصيلي، با رعايت اصول و ضوابط تشكيلاتي، با تأييد سازمان امور اداري و استخدامي. ه - پيشنهاد نصب و عزل مسئولين حوزه‌هاي جهاد مركز و مسئولين ستادهاي مستقل و سازمان‌هاي وابسته به وزير جهاد. و - بررسي و تصويب بودجه پيشنهادي سالانه و توزيع اعتبارات مربوطه. ز - تصويب خط مشي و سياست‌هاي كلي برنامه‌هاي آموزشي، جهت ارتقاء كيفي و رشد كارآيي جهادگران. ح - اظهار نظر و اخذ تصميم در مورد لوايح و طرح‌هاي قانوني مربوط به جهاد. تبصره - مصوبات شوراي مركزي را، وزير در صورت تأييد، ابلاغ مي‌نمايد. ماده 4 (منسوخه 25ˏ12ˏ1382) - فعاليت‌هاي مختلف در جهاد با رعايت اصول سنخيت و ارتباط، با همكاري سازمان امور اداري و استخدامي به تعدادي حوزه تفكيك‌گرديده كه هر حوزه نيز با تركيب مناسبي از امور مرتبط، به واحدهايي تقسيم مي‌شود، مسئول هر حوزه معاون وزير خواهد بود.