اختلافات ناشي از اجراي موافقتنامه اختلافاتي كه دراجراي اين موافقتنامه حادث شود با توافق متقابل توسط نهادهاي قضائي ذي صلاح طرفين متعاهد حل و فصل خواهد شد. كميسيون مشتركي از نمايندگان نهادهاي دولتي مربوط طرفين متعاهد نيز با هدف حل و فصل اختلاف نظر مي تواند تشكيل شود.
ماده 48
از قانون موافقتنامه معاضدت قضايي متقابل در امور كيفري بين دولت جمهوري اسلامي ايران و دولت تركمنستان — مصوب 1386/01/28