ساختار سازماني اكو اركان اصلي اكو عبارت خواهند بود از شوراي وزيران، شوراي نمايندگان دائم، شوراي برنامه ريزي منطقهاي، دبيرخانه و مؤسسات تخصصي درزمينههاي خاص همكاري. نهادهاي منطقهاي و كميتههاي ويژه نيز مي تواند با تصميم شوراي وزيران ايجاد گردد.