شوراي وزيران شوراي وزيران عاليترين هيأت سياستگزاري و تصميمگيري اكو خواهد بود. شوراي وزيران متشكل است از وزراي خارجه كشورهاي عضو يا ديگرنمايندگاني كه مقام وزارت داشته باشند و از طرف دولتها معرفي گردند. شوراي وزيران حداقل سالي يكبار بطور متناوب در سرزمين كشورهاي عضوتشكيل جلسه خواهد داد. اجلاسهاي فوقالعاده شورا نيز ميتواند در سرزمين كشورهاي عضو يا در هر مكان مورد توافق كشورهاي عضو برگزار گردد.شوراي وزيران در صورت لزوم ميتواند پيشنهاد تشكيل اجلاسهاي ساير وزراء را براي تنظيم برنامهها و طرحهايي در زمينههاي مربوط به كار آنها ازطريق اجلاسهاي بخشي يا مشترك وزارتي ارائه دهد.